MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 20392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019566	AT	3	6	697	702	50 %	50 %	0 %	0 %	426400512
2	NC_019566	TGC	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400512
3	NC_019566	ATG	3	9	795	803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400512
4	NC_019566	ATT	2	6	842	847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400512
5	NC_019566	GT	3	6	849	854	0 %	50 %	50 %	0 %	426400512
6	NC_019566	TAT	2	6	922	927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400512
7	NC_019566	CCA	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400512
8	NC_019566	CTG	2	6	990	995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400512
9	NC_019566	GGA	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400512
10	NC_019566	TAT	2	6	1135	1140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400512
11	NC_019566	GCA	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400512
12	NC_019566	TAT	2	6	1331	1336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400513
13	NC_019566	A	6	6	1383	1388	100 %	0 %	0 %	0 %	426400513
14	NC_019566	GCT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400513
15	NC_019566	CTAT	2	8	1435	1442	25 %	50 %	0 %	25 %	426400513
16	NC_019566	TGT	2	6	1592	1597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400513
17	NC_019566	TGC	2	6	1598	1603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400513
18	NC_019566	GA	3	6	1612	1617	50 %	0 %	50 %	0 %	426400513
19	NC_019566	TGT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400513
20	NC_019566	ATCG	2	8	1677	1684	25 %	25 %	25 %	25 %	426400513
21	NC_019566	GAT	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400513
22	NC_019566	GTT	2	6	1859	1864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400514
23	NC_019566	ACA	2	6	1898	1903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400514
24	NC_019566	TCG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400514
25	NC_019566	ATG	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400514
26	NC_019566	GTG	2	6	2018	2023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400514
27	NC_019566	GTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400514
28	NC_019566	CT	3	6	2133	2138	0 %	50 %	0 %	50 %	426400514
29	NC_019566	CTT	2	6	2156	2161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400514
30	NC_019566	GTA	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400514
31	NC_019566	CAG	2	6	2264	2269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400514
32	NC_019566	ATT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400514
33	NC_019566	AAAG	2	8	2448	2455	75 %	0 %	25 %	0 %	426400514
34	NC_019566	AAC	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400514
35	NC_019566	GTT	2	6	2552	2557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400515
36	NC_019566	ATT	2	6	2597	2602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400515
37	NC_019566	TCT	2	6	2656	2661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400515
38	NC_019566	T	6	6	2715	2720	0 %	100 %	0 %	0 %	426400515
39	NC_019566	GTC	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400515
40	NC_019566	TTGACA	2	12	2897	2908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426400515
41	NC_019566	TTTA	2	8	2963	2970	25 %	75 %	0 %	0 %	426400515
42	NC_019566	ATTG	2	8	2973	2980	25 %	50 %	25 %	0 %	426400515
43	NC_019566	TAA	2	6	3015	3020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400515
44	NC_019566	A	7	7	3065	3071	100 %	0 %	0 %	0 %	426400515
45	NC_019566	GTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400515
46	NC_019566	GTG	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400515
47	NC_019566	AT	3	6	3206	3211	50 %	50 %	0 %	0 %	426400516
48	NC_019566	T	8	8	3225	3232	0 %	100 %	0 %	0 %	426400516
49	NC_019566	AT	3	6	3237	3242	50 %	50 %	0 %	0 %	426400516
50	NC_019566	GTA	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400516
51	NC_019566	CTAG	2	8	3301	3308	25 %	25 %	25 %	25 %	426400516
52	NC_019566	TC	3	6	3313	3318	0 %	50 %	0 %	50 %	426400516
53	NC_019566	AAT	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400516
54	NC_019566	T	6	6	3383	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	426400516
55	NC_019566	ATT	2	6	3492	3497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400516
56	NC_019566	TAG	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400516
57	NC_019566	AAAAG	2	10	3588	3597	80 %	0 %	20 %	0 %	426400516
58	NC_019566	AAT	2	6	3615	3620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400516
59	NC_019566	G	6	6	3643	3648	0 %	0 %	100 %	0 %	426400516
60	NC_019566	ATGA	2	8	3649	3656	50 %	25 %	25 %	0 %	426400516
61	NC_019566	TTA	2	6	5060	5065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400517
62	NC_019566	CAG	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400517
63	NC_019566	TGA	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400517
64	NC_019566	ATT	2	6	5191	5196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400517
65	NC_019566	GCT	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400517
66	NC_019566	TTGTAT	2	12	5333	5344	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	426400517
67	NC_019566	AAC	2	6	5361	5366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400517
68	NC_019566	AGT	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400517
69	NC_019566	TCA	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400517
70	NC_019566	AAC	2	6	5549	5554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400517
71	NC_019566	GT	3	6	5653	5658	0 %	50 %	50 %	0 %	426400517
72	NC_019566	CTG	2	6	5711	5716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400517
73	NC_019566	GAG	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400517
74	NC_019566	ATTGAG	2	12	5836	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400517
75	NC_019566	AG	3	6	5916	5921	50 %	0 %	50 %	0 %	426400517
76	NC_019566	ATC	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400517
77	NC_019566	CTG	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400517
78	NC_019566	TG	3	6	6062	6067	0 %	50 %	50 %	0 %	426400517
79	NC_019566	GAC	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400517
80	NC_019566	ATG	2	6	6296	6301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400517
81	NC_019566	AT	3	6	6514	6519	50 %	50 %	0 %	0 %	426400518
82	NC_019566	TTG	2	6	6525	6530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400518
83	NC_019566	A	10	10	6533	6542	100 %	0 %	0 %	0 %	426400518
84	NC_019566	A	8	8	6569	6576	100 %	0 %	0 %	0 %	426400518
85	NC_019566	TCTTTA	2	12	6589	6600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	426400518
86	NC_019566	CAA	2	6	6628	6633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400519
87	NC_019566	GCT	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400519
88	NC_019566	CGA	2	6	6727	6732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400519
89	NC_019566	ATC	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400519
90	NC_019566	GCTTTC	2	12	6891	6902	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	426400519
91	NC_019566	CGT	2	6	6986	6991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400519
92	NC_019566	CGC	2	6	7001	7006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400519
93	NC_019566	GTA	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400519
94	NC_019566	TA	3	6	7107	7112	50 %	50 %	0 %	0 %	426400519
95	NC_019566	T	7	7	7143	7149	0 %	100 %	0 %	0 %	426400519
96	NC_019566	CAT	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400519
97	NC_019566	TA	3	6	7173	7178	50 %	50 %	0 %	0 %	426400519
98	NC_019566	GAA	2	6	7193	7198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400519
99	NC_019566	GTA	2	6	7267	7272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400519
100	NC_019566	CTC	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426400519
101	NC_019566	GAG	2	6	7410	7415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400519
102	NC_019566	AAT	2	6	7464	7469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400519
103	NC_019566	CTTAAT	2	12	7482	7493	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400519
104	NC_019566	AGC	2	6	7533	7538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400519
105	NC_019566	TTG	2	6	7543	7548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400519
106	NC_019566	ATC	2	6	7599	7604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400519
107	NC_019566	TGCC	2	8	7628	7635	0 %	25 %	25 %	50 %	426400519
108	NC_019566	AT	3	6	7685	7690	50 %	50 %	0 %	0 %	426400519
109	NC_019566	GAT	2	6	7715	7720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400519
110	NC_019566	TGC	2	6	8032	8037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400519
111	NC_019566	GCG	2	6	8070	8075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426400519
112	NC_019566	ATG	2	6	8277	8282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400519
113	NC_019566	AAT	2	6	8442	8447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400519
114	NC_019566	AAC	2	6	8452	8457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400519
115	NC_019566	CGA	2	6	8494	8499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400519
116	NC_019566	TGT	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400519
117	NC_019566	TA	4	8	8594	8601	50 %	50 %	0 %	0 %	426400519
118	NC_019566	AGC	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400519
119	NC_019566	GCC	2	6	8631	8636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400519
120	NC_019566	A	6	6	8637	8642	100 %	0 %	0 %	0 %	426400519
121	NC_019566	AGT	2	6	8664	8669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400519
122	NC_019566	CATTC	2	10	8687	8696	20 %	40 %	0 %	40 %	426400519
123	NC_019566	TGG	2	6	8700	8705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400519
124	NC_019566	ACT	2	6	8740	8745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400519
125	NC_019566	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400519
126	NC_019566	A	6	6	8949	8954	100 %	0 %	0 %	0 %	426400519
127	NC_019566	CTG	2	6	8972	8977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400519
128	NC_019566	CTG	3	9	9005	9013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400519
129	NC_019566	TCG	2	6	9022	9027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400519
130	NC_019566	GTA	2	6	9201	9206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400519
131	NC_019566	ATTG	2	8	9322	9329	25 %	50 %	25 %	0 %	426400519
132	NC_019566	AGC	2	6	9336	9341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400519
133	NC_019566	GA	3	6	9389	9394	50 %	0 %	50 %	0 %	426400519
134	NC_019566	T	6	6	9399	9404	0 %	100 %	0 %	0 %	426400519
135	NC_019566	AATG	2	8	9426	9433	50 %	25 %	25 %	0 %	426400519
136	NC_019566	TCT	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400520
137	NC_019566	ATCTTA	2	12	9583	9594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400520
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139	NC_019566	CA	3	6	9723	9728	50 %	0 %	0 %	50 %	426400520
140	NC_019566	TA	3	6	9755	9760	50 %	50 %	0 %	0 %	426400520
141	NC_019566	ATT	2	6	9837	9842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400520
142	NC_019566	ATA	2	6	9883	9888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400520
143	NC_019566	TGC	2	6	9999	10004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400521
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148	NC_019566	TTTC	2	8	10184	10191	0 %	75 %	0 %	25 %	426400521
149	NC_019566	ACG	2	6	10227	10232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400521
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151	NC_019566	TAA	2	6	10374	10379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400521
152	NC_019566	CTG	2	6	10406	10411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400521
153	NC_019566	ATCC	2	8	10427	10434	25 %	25 %	0 %	50 %	426400521
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156	NC_019566	CG	3	6	10578	10583	0 %	0 %	50 %	50 %	426400521
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159	NC_019566	TCA	2	6	10702	10707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400521
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164	NC_019566	T	9	9	11101	11109	0 %	100 %	0 %	0 %	426400522
165	NC_019566	AT	3	6	11303	11308	50 %	50 %	0 %	0 %	426400523
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169	NC_019566	TGT	2	6	12023	12028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400524
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252	NC_019566	GTG	2	6	18046	18051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400529
253	NC_019566	A	6	6	18073	18078	100 %	0 %	0 %	0 %	426400529
254	NC_019566	T	7	7	18149	18155	0 %	100 %	0 %	0 %	426400529
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258	NC_019566	TAT	2	6	18356	18361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400529
259	NC_019566	AGTT	2	8	18404	18411	25 %	50 %	25 %	0 %	426400529
260	NC_019566	T	6	6	18410	18415	0 %	100 %	0 %	0 %	426400529
261	NC_019566	GCTT	2	8	18513	18520	0 %	50 %	25 %	25 %	426400529
262	NC_019566	ATG	2	6	18522	18527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400529
263	NC_019566	ATCT	2	8	18534	18541	25 %	50 %	0 %	25 %	426400529
264	NC_019566	CAT	2	6	19680	19685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400530
265	NC_019566	T	6	6	19695	19700	0 %	100 %	0 %	0 %	426400530
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282	NC_019566	TTA	2	6	20369	20374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400530
283	NC_019566	TGG	2	6	20380	20385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400530
284	NC_019566	TAA	2	6	20436	20441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400530
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289	NC_019566	A	7	7	21256	21262	100 %	0 %	0 %	0 %	426400532
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291	NC_019566	A	6	6	21278	21283	100 %	0 %	0 %	0 %	426400532
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299	NC_019566	AATC	2	8	22289	22296	50 %	25 %	0 %	25 %	426400533
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380	NC_019566	CTT	2	6	30128	30133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400539
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388	NC_019566	T	8	8	30384	30391	0 %	100 %	0 %	0 %	426400539
389	NC_019566	AGC	2	6	30429	30434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400539
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